為提昇醫療院所對廢棄物及廢水之管理能力與成效，衛生署特於97年委託本計畫進行包括廢棄物減量與資源回收推動工作、廢棄物廢水產生量普查、檢討再利用相關管理辦法與種類檢討、輔導違反環保法規醫院與推廣自主管理制度、提供相關諮詢服務與網站資訊服務等五大類19項工作，期能建立醫療院所近年來之廢棄物產生狀況資料，且同時藉由自主管理制度之推廣，建立適當之輔導策略，以提昇醫療院所環境管理能力，降低違規率，最終可達到提升醫療院所環境管理績效之目的。
本計畫已於98年11月30日完成各項工作，包括自主管理制度建置與35家醫院輔導、近五年廢棄物廢水產生量普查與推估、再利用率與減量率公式檢討、共同清除處理機構管理辦法修訂檢討、再利用管理辦法檢討修訂、再利用種類及其管理方式檢討修訂、評估廢食用油及注射液軟袋等兩項再生資源、完成6家醫療機構參與資源回收績效評比之邀集與初評協助、增修訂兩項手冊（「醫療廢棄物減量及資源回收指引手冊」與「生物醫療廢棄物判定手冊」）、以經濟、現況、法制等面向評估共同清除處理機構成立資源回收轉運站之可行性、完成14家次之違規醫院輔導、進行200件諮詢服務、以及維護與建置全國醫療廢棄物處理網等。藉由完成前述工作項目，本計畫已可達到預期目標與效益。
